基因检测的方法有哪些?哪一种是最好的?

　　一、是不是检测的基因越多越好?

　　答案：NO

　　要根据实际需要评估的药物，选择相对应的基因检测项目，尤其是靶向药物，每个药物的疗效/耐药靶点基因是比较固定的。

　　随着高通量测序技术(NGS)技术的崛起，商业市场将几个到成百上千个基因打包检测，即测序Panel 或“基因套餐”，但是由于目前已上市的靶向药物比较固定，当测序基因数量覆盖足够靶点基因后，再增加基因数量未必能进一步提供更多的靶向药物指导，这些Panel 提供的往往是一些额外的评析，如遗传评估;

　　此外，Panel的测序结果还和其测序覆盖度(可覆盖的目前基因区域)、测序深度(可使用测序数据量衡量)等相关。基于以上几点，对于NGS的测序Panel 大小选择应根据实际需求判断，而非单一按照基因量多少选择。

　　二、基因检测的方法有哪些?哪一种是最好的?

　　基因检测的方法是直接与基因检测类型相关联的，每种基因检测类型都有较为合适基因检测方法。由于基因检测体系比较复杂，最好的方法是根据需要评估的药物选择相应的检测项目。

　　下面，小编为大家简单总结一下各个基因检测类型对应的常见检测方法：

　　(1) 基因多态性：PCR;

　　(2) 相对表达检测：荧光定量PCR;

　　(3) 点突变/小片段插入缺失：PCR;

　　(4) 大片段插入缺失/拷贝数变异/融合(结构变异)：FISH;

　　(5) 多基因多类型突变(相对表达检测除外)：NGS;

　　(6) 多肽和蛋白质检测：免疫组化(IHC)。

　　三、肿瘤基因检测选取什么样本才是最好的?

　　目前对于肿瘤基因检测，组织样本仍是金标准，且部分基因检测项目仅组织样本才可以实现。因此，有条件的情况下，应优先选择组织样本。

　　若无法取得组织样本，最好是临床处于中晚期(临床III期后)的患者再选用外周血进行ctDNA基因检测。同时，外周血靶向药物ctDNA基因检测最好是在没有经过任何治疗之前进行，因为放化疗和靶向治疗均会对外周血ctDNA检测结果产生影响。

　　按照检出率，新鲜组织>石蜡切片>胸腹水上清>胸腹水细胞>外周血。

　　四、肿瘤基因检测除了指导肿瘤用药，还有哪些应用方向?

　　(1)肿瘤遗传易感基因检测

　　肿瘤的发生发展与遗传具有重要的联系，很多基因突变会在家系中遗传，携带这些突变基因的人群，患肿瘤的风险更高。基因检测可以预测相应肿瘤的发生风险，进行积极的健康管理。

　　(2)肿瘤的早筛早诊

　　目前临床上常用的肿瘤筛查技术主要是血清肿瘤标志物和影响检查，随着液体活检等技术的成熟应用，通过进行DNA甲基化或者miRNA检测即可实现肿瘤的早筛早诊，从而进行临床干预。

　　(3)肿瘤患者的疗效跟踪和评估

　　目前，ctDNA和CTC等液体活检技术都可以实现肿瘤治疗的疗效跟踪和评估。比如

　　ctDNA水平在不同的患者之间有很大的差异，但随着时间的推移，单个患者的ctDNA水平与肿瘤负荷和治疗效果的变化密切相关。一些研究表明，当肿瘤细胞死亡导致ctDNA释放增加时，ctDNA水平可能会在治疗开始后短暂升高。然而，在治疗开始1~2周后，对治疗有反应的患者的ctDNA水平急剧下降。在某些方面，ctDNA的变化在预测治疗效果方面要优于标准肿瘤标志物。这也是ctDNA可以在临床上用作癌症治疗效果长期跟踪的一个重要原因。

　　(4)肿瘤的复发监测(MRD检测)

　　目前来说，手术依然是肺癌等实体瘤的主要治疗方式。患者术后体内仍存在影像学方法无法检出的残留肿瘤细胞或者微小病灶，属于肿瘤进展的隐匿阶段。患者体内残留的癌细胞数量可能很少，暂时不会引起任何体征或症状，但它们可能导致未来肿瘤的进展或复发转移;微小残留病灶(MRD)，通过传统影像学(包括PET/CT)或实验方法不能发现，但通过液体活检技术可以实现。

　　MRD作为一种生物标志物，阳性结果意味着癌症治疗后仍可检测到残留(剩余)病灶(发现残余癌细胞，代表肿瘤持续存在和临床进展的可能，患者复发风险较高，预后较差)，阴性结果表示癌症治疗后未检测到残留(剩余)病灶(未发现残余癌细胞，患者复发风险较低，预后较好)。所以，肿瘤复发监测(MRD检测)成为癌症治疗中不可或缺的一环。

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